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2015年5月Nature文章“BLAME IT ON THE ANTIBODIES”為整個(gè)科研屆敲響了一次警鐘?？贵w選擇不當(dāng)會(huì)使實(shí)驗(yàn)室遭遇“重復(fù)性危機(jī)”，甚至是“毀滅性”結(jié)果！
面對市場上超過300家的抗體公司，200多萬種的抗體?？贵w質(zhì)量參差不齊，服務(wù)水平差距明顯，科研者們該如何選擇？
HPA金標(biāo)抗體除了具有高特異性/低交叉反應(yīng)的優(yōu)點(diǎn)，每種抗體均有超過700多張IHC、IF和WB圖片驗(yàn)證數(shù)據(jù)，可謂理想的實(shí)驗(yàn)選擇。
什么是HPA金標(biāo)抗體？
The Human Protein Atlas是一個(gè)公共門戶，隸屬于人類蛋白質(zhì)組學(xué)研究項(xiàng)目。該項(xiàng)目的目標(biāo)是生產(chǎn)覆蓋全基因組所有基因的抗體，系統(tǒng)性地探索人類蛋白質(zhì)組奧秘。該項(xiàng)目的完成取決于高通量金標(biāo)抗體生產(chǎn)技術(shù)與高質(zhì)量的蛋白表達(dá)譜(多種人類組織和細(xì)胞獲得)的結(jié)合。目前HPA已公布1.8萬多種抗體，每種抗體均有超過700多張IHC、IF和WB圖片驗(yàn)證數(shù)據(jù)，被稱為：HPA金標(biāo)抗體。
為什么稱之為HPA金標(biāo)抗體？
HPA金標(biāo)抗體（Prestige Antibodies）是具有高度特異性的抗體，其抗體應(yīng)用經(jīng)過全面驗(yàn)證，所有特異性驗(yàn)證數(shù)據(jù)都可以在Human Protein Atlas (HPA) Portal (proteinatlas.org)獲得。金標(biāo)抗體的高度特異性/低交叉反應(yīng)主要基于以下幾個(gè)方面的質(zhì)量控制：1. 抗原序列(位置)選擇；2. 多克隆抗體親和層析純化；3. 多種實(shí)驗(yàn)方法驗(yàn)證；4. 金標(biāo)抗體嚴(yán)格審批流程。
1.抗原選擇
HPA金標(biāo)抗體的免疫抗原是重組人蛋白表位識(shí)別標(biāo)簽(PrESTs)，表位識(shí)別標(biāo)簽一般含有50-150個(gè)氨基酸。表位識(shí)別標(biāo)簽經(jīng)過設(shè)計(jì)和篩選，使得它們含有*的表位，并且適合激發(fā)高特異性的抗體。通過對人全基因組掃描的方式，確保用于生產(chǎn)抗體的蛋白表位識(shí)別標(biāo)簽與其它蛋白有zui低的同源性。同時(shí)，抗原表位還會(huì)排除信號(hào)肽和蛋白跨膜區(qū)。
2.親和層析純化
HPA金標(biāo)抗體通過親和層析方式進(jìn)行純化(以PrESTs抗原作為配基)，采用三步法免疫層析的純化工藝：HisABP特異性標(biāo)簽去除，PrESTs特異性捕獲，zui后通過排阻色譜進(jìn)行緩沖液的交換，不僅保證了抗體的純度，同時(shí)有利于抗體長期保存。
3.多種實(shí)驗(yàn)方法驗(yàn)證
· 蛋白芯片
金標(biāo)抗體的特異性和純度首先經(jīng)過蛋白芯片來驗(yàn)證。一系列重組人蛋白表位識(shí)別標(biāo)簽(PrESTs)標(biāo)記在微矩陣芯片上，通過熒光信號(hào)確定抗體的特異性。
· 免疫組化 (IHC)
免疫組化驗(yàn)證主要是對目標(biāo)蛋白的檢測以及其在組織、細(xì)胞和亞細(xì)胞水平的定位實(shí)驗(yàn)。金標(biāo)抗體需要在46個(gè)正常人類組織(每個(gè)實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次)、432個(gè)人腫瘤組織樣本中(20種常見腫瘤組織，每種腫瘤組織來源于不同病人，zui多的一種腫瘤樣本來源于12個(gè)不同的病人)做蛋白表達(dá)分析。此外，還有56種細(xì)胞系的免疫染色實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。
· Western Blot (WB)
金標(biāo)抗體還需通過對肝臟和扁桃體組織提取物、去除IgG和白蛋白的混合血漿以及兩種人類細(xì)胞系中的蛋白表達(dá)進(jìn)行WB驗(yàn)證。此外，金標(biāo)抗體還要在過表達(dá)的體系中做WB驗(yàn)證。
· 免疫熒光 (IF)
金標(biāo)抗體需要通過的人類三個(gè)細(xì)胞系中(U-2 OS, A-431和U-251 MG)做亞細(xì)胞定位的免疫熒光驗(yàn)證，以獲得更詳細(xì)的亞細(xì)胞定位信息。同時(shí)，也會(huì)有轉(zhuǎn)錄水平的驗(yàn)證，以確保金標(biāo)抗體實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。
注釋：
正常組織、腫瘤組織和細(xì)胞的免疫組化圖片都會(huì)經(jīng)過病理學(xué)家的檢驗(yàn)和注釋。同時(shí)，針對不同的目的蛋白，金標(biāo)抗體驗(yàn)證的免疫組化、WB和免疫熒光的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)也會(huì)和發(fā)表文獻(xiàn)以及生物信息學(xué)的數(shù)據(jù)作比較，以確保驗(yàn)證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。
4.嚴(yán)格的審批流程
金標(biāo)抗體認(rèn)證通過必須是綜合考慮免疫組化、WB和免疫熒光的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)果以及生物信息學(xué)和參考文獻(xiàn)。HPA項(xiàng)目有時(shí)候針對同一個(gè)蛋白也會(huì)生產(chǎn)一對抗體，彼此之間抗原表位不同，兩個(gè)抗體之間相互驗(yàn)證。大多數(shù)情況下，這兩個(gè)抗體的IHC驗(yàn)證數(shù)據(jù)是一致的，如果IHC結(jié)果有差異，可能存在蛋白異構(gòu)體的現(xiàn)象，例如不同的拼接體或者翻譯后修飾。超過一半的金標(biāo)抗體通過嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)驗(yàn)證、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)或者生物信息學(xué)預(yù)測的結(jié)果是一致的，這部分金標(biāo)抗體就會(huì)通過認(rèn)證，在HPA公布。
HPA金標(biāo)抗體能為你的實(shí)驗(yàn)帶來什么？
高特異性的實(shí)驗(yàn)結(jié)果：金標(biāo)抗體均通過嚴(yán)格抗原序列比對篩選
豐富的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證圖片：每一支金標(biāo)抗體都經(jīng)過蛋白芯片、免疫組化、WB和免疫熒光的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膮⒖嘉墨I(xiàn)和生物信息學(xué)預(yù)測：每一支金標(biāo)抗體除了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，發(fā)表文獻(xiàn)和生物信息學(xué)預(yù)測也是抗體的重要參數(shù)。
HPA金標(biāo)抗體應(yīng)用舉例
下圖為抑癌基因ARID1A (抗體貨號(hào)：HPA005456)在不同組織和細(xì)胞系中的表達(dá)和分布。
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